有反流物刺激和损伤食管以外的组织和器官引起的咽喉炎、慢性咳嗽和哮喘。对一些病因不明久治不愈的上述疾病患者，要注意是否存在胃食管反流，伴有烧心和反流症状有提示作用，但少部分患者以咽喉炎、慢性咳嗽或哮喘为首发或主要表现。严重者可发生吸入性肺炎，甚至出现肺间质性纤维化。

　　一些患者诉咽部不适，有异物感、面团感或者堵塞感，但无真正的吞咽困难称为癔球症。近年研究发现部分患者也与胃食管反流相关，胃食管反流的主要并发症有上消化道出血、食管狭窄、巴瑞特食管，其中巴瑞特食管是比较严重的表现，是属于癌前病变，其腺癌的发生率较正常人高30-50倍。所以一旦发生巴瑞特食管，一般是建议需要手术治疗。