甲型流感病毒是一种常见的流感病毒，最容易发生抗原变异，可以分为很多种亚型，分亚型的依据是根据病毒的两种表面糖蛋白，分别是H糖蛋白和N糖蛋白。

　　至今发现能够感染人的甲型流感病毒亚型包括有H1N1，H5N1，H7N1，H7N2，H7N3，H7N7，H7N9，H9N2和H10N8，其中H1，H5，H7亚型为高致病性，H1N1，H5N1，H7N9是尤为值得关注的甲型流感病毒亚型。