等位基因又称对偶基因，一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因。例如豌豆花的红色和白色、人的单眼皮和双眼皮、兔子的长毛和短毛等即为一对等位基因所控制的性状。AA是相同基因不是等位基因，A与a是一对等位基因。